В 2004-2005 годах была проведена первая реконструкция молочного комплекса в п.Заря с переводом на беспривязное содержание с доением в доильном зале типа Елочка 2х10 фирмы SAC. С 2006 года все поголовье крс отделения Заря размещено на молочном комплексе. В 2007-2008 года были построены 3 телятника с холодным методом содержания телят. В 2014 году в рамках программы «Развитие молочного животноводства Вологодской области на 2013-2020 годы» была проведена вторая реконструкция молочного комплекса с целью увеличения количества скотомест. В это же время проведена модернизация доильного зала. 

В 2016-2017 годах построена первая очередь животноводческой фермы на 1400 коров и 1728 голов молодняка вблизи д.Гончарка. В составе первой очереди построены коровник на 600 мест с беспривязным содержанием, доильно-молочный блок с доильным залом европараллель 2х24 с административно-бытовым блоком и родильным отделением на 230 мест, а также вся необходимая в первую очередь инфраструктура (дороги, система навозоудаления, санпропускник). 

В 2019 г построена вторая очередь животноводческой фермы на 1400 коров и 1728 голов молодняка вблизи д.Гончарка. В составе второй очереди построены коровник на 570 мест с беспривязным содержанием, навес для телят на 289 мест, силосные траншеи 3шт, навес для кормов.

В 2021 году начато строительство завершающей третьей очереди животноводческой фермы на 1400 коров и 1728 голов молодняка вблизи д.Гончарка. Будут построены 2 телятника общей вместимостью 1439 голов, силосные траншеи 6шт, навесы для сена и соломы 3шт, автовесовая, гараж, лагуны со зданием перекачки навоза.

Также в настоящее время ведется технологическое проектирование реконструкции животноводческого комплекса в д.Ильинское на 500 коров со шлейфом с целью перевода дойного стада на беспривязное содержание и строительства животноводческой фермы на 2500 коров со шлейфом вблизи д.Малоновленское.

Благодаря внедрению новых технологий улучшаются условия содержания, увеличивается продуктивность животных.

Животноводство является основной товарной отраслью, реализация продукции животноводства составляет до 95% от всей выручки предприятия. Вместе с тем, отрасль животноводства имеет достаточно высокую рентабельность.

Особое внимание уделяется качеству производимой продукции, т. к. от этого напрямую зависит цена реализации. 99% молока хозяйство продает высшими сортами, ведется работа по повышению уровня белка и жира в молоке.

Племенная работа хозяйства направлена на получение потомства наилучшего качества. Закрепление быков-производителей к маточному поголовью происходит по индивидуальному подбору. ОАО «Заря» работает с «Вологодским», «Череповецким» и ООО «Генус Эй Би Эс Рус» (г.Тула) племпредприятиями. 77% стада закреплено быками линий Вис Бэк Айдиал и Рефлекшн Соверинг, 15% линии Монтвик Чифтейн. 8% Прочие линии, линия Танталуса, Анас Адема, Пабст Говернер. Для создания высокопродуктивного стада проводится голштинизация стада (кровность 73%). Ежегодно проводится линейная оценка стада.

В 2020 году в хозяйстве было получено 3984 голов живых телят. Выход телят от 100 коров составил 83%. Продолжительность производственного использования коров составляет 3 лактации. Сервис-период 103 дня. Осеменение искусственное на всём маточном поголовье ректо-цервикальным методом пайетами. В среднем стаде 64% стельных коров. ОАО «Заря» Вологодского района получило статус племенного репродуктора 22 сентября 2017 года. Хозяйство ежегодно исследует 10% стада на иммуногенетический контроль потомства.